Przesyłki z testami DNA

Witam,

Dziękuję za informacje i przyjęcie do projektu. Do swojej haplogrupy już się też zapisałem.

Pozdr,

Piotr Kaszyca

Proszę napisać na PRIV jakie wyniki Pan ma. joannask@tlen.pl

Hi Damian,

I agreed to be part of the MyHeritage’s project „Founder Population”.
First at all, the DNA test is the same like others vendors.
The result is three CSV (plain text file with separate comma) files.
On the first, there are about 700,000 SNPs lines starting from chromosome number #1 to #22.
For each SNP, they provide the identifier, chromosome number, base pair position and genotype.The genotype is reported on the forward (+) strand with respect to the human reference build 37.
The second file gather data about chromosome X.
The third file contains small data about chromosome Y.
I think the CSV structure files is the same like FTDNA, 23andme, … .
With the autosomal tools, I can match any other DNA (Ancien DNA, other living people and so on). So I discover that my DNA match most BR2 (Hungary Ancient DNA) 30% but it is a estimation.
But, MyHeritage doesn’t provide so far ethnicity report. There are working on it.

I am sot sure but I would like to know my Haplogroup regarding my Y DNA data.
But in fact I cannot do much so far with only the autosomal DNA raw data.

What I can do is wait for the ethnicity report but the quality of DNA matches is not as good as FTDNA Report.

Link MyHeritage DNA blog

By the way, I don’t know if it is useful to join the project Silesia.

Kind regards.

Ja odpowiem w ten sposób. Firm, które wykonują badania DNA jest kilka i każda ma swoje wady i zalety. W związku z tym każdy musi się zastanowić, co najbardziej go interesuje i czego się chce dowiedzieć, jeżeli miałbym bardzo skrótowo opisać coś o każdej z firm to powiedziałbym, że:
– Family Tree DNA (FTDNA) – jest firmą, która ma najlepszy stosunek ceny do oferowanych możliwości w przypadku podstawowych badań, czyli Y37, DNA autosomalne (FamilyFinder) oraz mtDNA. Mam tu na myśli nie tylko kwestie ceny samego testu, ale i przesyłki. Oczywiście najlepiej jest poczekać na promocje, które regularnie się pojawiają, bo standardowa cena nie jest aż tak zachęcająca. Bardzo istotne dla osoby rozpoczynającej przygodę z genealogią genetyczną mogą być wyszukiwarki krewnych spośród osób znajdujących się w bazie, a tych jest już naprawdę sporo. Ciekawe mogą się okazać także inne narzędzia, które oferuje ta firma.
– YSEQ – oferuje bardzo szeroką gamę badań i w wielu przypadkach wypada znacznie korzystniej cenowo, niż FTDNA. Jednak nie posiada takich narzędzi ułatwiających odnalezienie krewnych, jak jest to w przypadku FTDNA. Zatem jest to świetna firma do pogłębiania swoich badań, ale może nie koniecznie do rozpoczynania przygody z genealogią genetyczną. Na przykład, gdy już wstępnie określimy haplogrupę, np. w FTDNA to następnie w YSEQ znajdziemy bardzo korzystne cenowo panele do rozszerzenia badania.
– Ancestry – wydaje się że cenowo wypada trochę gorzej, niż konkurencja choć nie wiem jak wyglądają tam promocje. Bardzo ciekawie wygląda prezentowane na ich stronach narzędzie Genetic Communities, ale niestety nie badałem się w tej firmie więc trudno mi powiedzieć czy rzeczywiście z tak dużą precyzją określa pochodzenie etniczne, jak prezentują to na swoich filmach. Jednak trzeba zaznaczyć, że Ancestry oferuje tylko badanie chromosomów autosomalnych.
– MyHeritage – posiada bardzo zbliżony, jeżeli nawet nie identyczny test autosomalny, co FamilyFinder w ramach FTDNA i podobny interfejs. Badania wykonuje bowiem to samo laboratorium, co w przypadku FTDNA.
– 23andMe – oferuje dwa rodzaje testów, w szczególności interesujący może być ten droższy, jeżeli zależy nam na tych fragmentach naszego DNA z których możemy wyczytać coś więcej na temat swojego zdrowia. Jeżeli się nie mylę to w ramach tego badania określana jest także haplogrupa YDNA i mtDNA, ale bardzo płytko.

Użyteczność dla projektu SILESIA DNA zależy od wybranego testu:
– DNA autosomalne – jeżeli chodzi o testy autosomalne to staramy się je jakoś wykorzystać, choć jest to dość trudne. Do tego trzeba wykorzystywać kalkulatory, które policzyły by np. czy ktoś jest bliżej spokrewniony z kimś czy dalej.
– YDNA – to na razie ten fragment DNA, który jest nam najłatwiej analizować, więc wyniki badań określających haplogrupę są zawsze mile widziane. W tym przypadku nie są nam potrzebne nawet dane źródłowe, a jedynie określenie do jakiej haplogrupy się należy lub jakie SNP się posiada oraz data i miejsce gdzie urodził się najstarszy znany przodek.
– mtDNA – w przypadku DNA mitochondrialnego staramy się już budować jakąś bazę, ale wyników jest na razie dość mało, jednak podobnie jak w przypadku YDNA każda informacja jest dla nas cenna, np. informacja o posiadanej haplogrupie.

Odnosząc się już bardzo konkretnie do zadanego pytania to powiem, że wynik testu z Ancestry będzie przydatny jedynie do analizy wyników autosomalnych w ramach Projektu SILESIA, które jak pisałem powyżej będziemy się starali wdrożyć. Trudno jest mi jest jednak w tej chwili powiedzieć jak wyglądała by kwestia zgodności wyników, gdyby próbować stworzyć kalkulator obejmujący wyniki z kilku firm. Ponadto z tego co wyczytałem z ich strony nie badają przy okazji chromosomu Y, więc nie będzie informacji o haplogrupy.

A co do polecenia jakiegoś testu DNA to mogę spróbować coś doradzić, ale muszę wiedzieć jakie informacje są najbardziej istotne, np. czy ma to być możliwość potwierdzenia czy ustalenia pokrewieństwa do około 5-6 pokolenia w tył czy raczej próba opisania historii patrylinearnej lub matrylinearnej linii drzewa genealogicznego ?

• Ta odpowiedź została zmodyfikowana 7 years, 5 months temu przez Krzysztof Bulla.

No to odpowiem dyplomatycznie
– test uniwersalny – to najlepiej byłoby zrobić test autosomalny. Do ustalania bliskiego pokrewieństwa do około 5/6 pokolenia jest bardzo dobry. Do określania etnicznego pochodzenia także. Jakieś kwestie zdrowotne też można na podstawie badania autosomalnego wywnioskować. Pojawia się jednak problem wyboru firmy. Z tego co widzę Ancestry bez promocji to 99 euro, czyli około 415 złotych. No i trudno określić jak wyglądały by koszty przesyłki. Nigdy nie korzystałem z usług tej firmy, więc nie wiem jak to wygląda technicznie, ani jakie są tam promocje. Ponadto bardzo jestem ciekaw na ile Ancestry DNA dokładnie określa pochodzenie etniczne. Jak już wspominałem na podstawie tego co jest umieszczone na stronie ich narzędzie do określania pochodzenia jest bardzo ciekawe. Może Pan zaryzykować i spróbować, a potem podzielić się z nami wiedzą.
Przestawie od razu alternatywną opcje, czyli FTDNA tutaj mogę powiedzieć coś więcej, a więc na razie cena testu to 89 dolarów, cena przesyłki to około 12 dolarów, a więc łącznie około 375 złotych. Jednak promocje bardzo często się zdarzają i warto poczekać, bo być może za miesiąc lub dwa coś się pojawi. Tutaj jednak mapa określająca pochodzenie etniczne jest delikatnie mówiąc nieprecyzyjna i raczej bym się na niej nie opierał. Za to przydatna może być baza krewnych genetycznych, tym bardziej że kilka osób z naszego towarzystwa jest w tej bazie.

– jeżeli chodzi o linię męską po nazwisku – tutaj warto zrobić Y37 w FTDNA, który obecnie kosztuje 169 dolarów, przesyłka około 12, a więc razem około 680 złotych. Oczywiście podobnie jak powyżej warto jednak poczekać na promocje. Znów po wykonaniu tego badania można dokupić jakiś panel rozszerzający w YSEQ. W ten sposób można naprawdę dość głęboko prześledzić swoją linię patrylinearną. Oczywiście jeżeli jesteśmy jakimś rzadkim okazem pod względem genetycznym to trudno może być ustalić, ale w przypadku tych „popularnych” haplogrup można w dość łatwy sposób znaleźć ludzi spokrewnionych z nami w linii patrylinearnej na początku naszej ery. Na tej postawie można już stawiać jakieś tezy co do swojego pochodzenia. No i oczywiście jeżeli przebadał się ktoś o takim samym nazwisku to ten test w sposób bezwzględny wskaże czy dwie tak samo nazywające się osoby pochodzą od wspólnego męskiego przodka i kiedy mniej więcej mógł on żyć.

Dziękuję za podpowiedzi.
Czy wszystkie te firmy udostępniają jakiś końcowy raport/podsumowanie?
Czy taki zewnętrzny test można potem połączyć z drzewem np Myheritage i Ancestry w celu znalezienia powiązań z innymi użytkownikami?

• Ta odpowiedź została zmodyfikowana 7 years, 5 months temu przez Adam.